"El gobierno alemán debe protestar ante el gobierno español y pedir una aclaración de lo ocurrido", dijo el presidente del Consejo Directivo del Bayern, Karlheinz Rummenigge en un comunicado.
El Bayern remitió a la cancillería declaraciones de testigos y vídeos sobre lo que el club alemán califica de "acciones brutales de policías españoles".
"Estamos horrorizados por la acción desmesurada", dijo Rummenigge.
En el intermedio del partido del martes, un grupo de policías entraron a la tribuna donde estaban muchos seguidores del Bayern. Se ha dicho que la razón de la acción era una pequeña pancarta que no había sido autorizada.
El Bayern ya había presentado una protesta formal ante la UEFA por lo que ha calificado de reacción desproporcionada.